為應洪水期防洪減少災害之需，提昇掌握及時水文資訊登錄於水情中心，建立水位、雨量監測系統，並及時傳輸本局水文資料庫以應防汛運作。自88年度起配合經濟部所推動之「台灣地區水文觀測現代化整體計畫」設立水位流量站9站、雨量站14站、氣象站1站、地盤下陷觀測站1站。